선문대학교 대학원은 애천(愛天), 애인(愛人), 애국(愛國)의 선문대학교 건학이념 아래 대학의 비전인 글로컬 공동체 선도 대학에 부합하도록 글로컬 문제 해결을 위한 학문 심화 및 융복합 선도 연구인력 양성을 비전으로 하고 있다.

이러한 비전을 실현하고 지역과 함께 하며 지역의 국제화와 균형발전을 이끌어 나가는 강소 대학원으로 거듭나기 위해, 우리 대학원은 주산학 글로컬 강소대학원 육성과 지역균형발전에 공헌할 선도연구인력 양성을 대학원의 사명으로 하고 있다.

또한 비전과 미션 달성을 위한 전략으로 문제해결형 교육체계 정립, 현장적용형 연구 활성화, 지속가능한 연구 생태계 구축, 산학협력/국제화 인프라 구축 등 4대 추진분야를 설정하였으며, 분야별로 액션 플랜을 수립하여 단계적으로 추진해 나가고 있다.